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)NucleaseFreeWater:4微升。(2)EMSAGelShift结合缓冲液5X:2微升。(3)细胞核蛋白或纯化的转录因子:2微升。(4)目的蛋白特异抗体:1微升。(5)标记好的探针:1微升。(6)总体积:10微升。2按照上述顺序依次加入各种试剂,在加入标记好的探针前先混匀,并且室温2025℃放置10分钟,从而消除可能发生的探针和蛋白的非特异性结合,或者让冷探针优先反应。然后加入标记好的探针,混匀,室温2025℃放置20分钟。3加入1微升EMSAGelShift上样缓冲液无色,10X,混匀后立即上样。注意:有些时候溴酚蓝会影响蛋白和DNA的结合,建议尽量使用无色的EMSAGelShift上样缓冲液。如果对于使用无色上样缓冲液在上样时感觉到无法上样,可以在无色上样缓冲液里面添加极少量的蓝色的上样缓冲液,至能观察到蓝颜色即可。五、电泳分析1用05XTBE作为电泳液。按照10V厘米的电压预电泳10分钟。预电泳的时候如果有空余的上样孔,可以加入少量稀释好的1X的EMSA上样缓冲液蓝色,以观察电压是否正常进行。2把混合了上样缓冲液的样品加入到上样孔内。在多余的某个上样孔内加入10微升稀释好的1X的EMSAGelShift上样缓冲液蓝色,用于观察电泳进行的情况。3按照10V厘米的电压电泳。确保胶的温度不超过30℃,如果温度升高,需要适当降低电压。电泳至EMSAGelShift上样缓冲液中的蓝色染料溴酚蓝至胶的下缘14处,停止电泳。4剪一片大小和EMSA胶大小相近或略大的比较厚实的滤纸。小心取下夹有EMSA胶的胶板,用吸水纸或普通草纸大致擦干胶板边缘的电压液。小心打开两块胶板中的上面一块注:通常选择先移走硅烷化的那块玻璃板,把滤纸从EMSA胶的一侧逐渐覆盖住整个EMSA胶,轻轻把滤纸和胶压紧。滤纸被胶微微浸湿后大约不足1分钟,轻轻揭起滤纸,这时EMSA胶会被滤纸一起揭起来。把滤纸侧向下,放平,在EMSA胶的上面覆盖一层保鲜膜,确保保鲜膜和胶之间没有气泡。5干胶仪器上干燥EMSA胶。然后用X光片压片检测,或用其它适当仪器设备检测。
其他
一、常见问答
1什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA复合r
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