，能够增强宿主对环境胁迫如干旱、低温、环境污染等的抗逆性维持宿主在非生物胁迫环境下的正常生长。23其他作用药用植物内生真菌具有一些其他有益的生理作用如抗结核、抗疟疾、防虫害、保鲜等。3内生真菌的研究方法
培养基的选择在内生真菌的分离过程中是非常重要的，通常是应用“非选择性”培养基，以利于尽可能的分离到更多的真菌，目前内生真菌可以在所有的人工培养基上生长，如麦芽提取物琼脂培养（MEA），马铃薯葡萄糖琼脂培养基（PDA）等。但是一些快速生长的和容易产孢的菌株经常覆盖了生长缓慢的菌株，所以需要通过一些方法减慢或限制真菌的快速生长，便于分离到生长较慢的菌株，以达到更全面的调查内生真菌群落的组成。现在的方法是在琼脂培养基中加入一些具有轻微杀真菌的试剂以限制菌株的快速生长，但是它们并不引起细胞的死亡，如放线菌酮（cycloheximide）等。
与一般微生物鉴定相比内生菌的鉴定较为复杂例如很多内生真菌离开植物体就不易产生孢子这给鉴定工作带来相当的难度。因此可以结合现代分子生物学手段进行内生菌鉴定。分子技术在内生真菌的分类学中也有广泛的应用，在对真菌系统发育进化研究中，主要采用片段分析如RAPD、PCRRFLP和DNA序列分析等分子技术，这些技术是当前比较成熟和主流的技术。4植物内生真菌在天然药物研究中的存在的问题和发展前景近二十年来，虽然内生真菌的研究的到重视，并在内生真菌的入侵机理、系统学、生态学和资源开发方面开展了一系列研究工作，但是对很多问题还不是很清楚，缺乏全面系统的研究，而且绝大多数植物的内生真菌还没有被研究。
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