税纳税义务发生时间同所得税纳税义务发生时间产生了差异。（1）2008年以前，所得税同营业税一样。（2）2008年，所得税按照收付实现制，而营业税依然按照权责发生制（财税【2003】16号文件）（3）2009年，所得税改为权责发生制，而营业税改为了收付实现制。两项政策均发生了变化。5、关于开票问题。营业税同企业所得税的冲突与协调。（1）由于营业税2009年就要确认收入，所以发票已开具。而企业所得税，虽然开具了发票，仍然不需要确认收入。（2）对于承租方，虽然第一年取得了全额发票，但是不能一次性扣除费用，而是按照《企业所得税法实施条例》第49条的规定，分期
f摊销。（3）如果是第三年收取租金，虽然第一年没有收到发票，仍然可以税前扣除。这也是权责发生制的体现。属于以票控税的困惑。6、文件表示为“可”，不严谨。法律用语如果表述为“可”意味着企业可以有选择权。例如：某企业2009年是免税年度，可能会愿意选择将10年的租金全部确认为收入。如果立法意图是统一规定为权责发生制，则应用“应”字，而不应当用“可”字。7、条例对利息、租金、特许权使用费，出于纳税必要资金原则的考量，都规定按照合同规定的收取款项时间，确定纳税义务时间。而79号文件对提前收取的租金的政策做了改变，利息、特许权使用费依然坚持按照合同规定的时间确定。（企便函【2009】33号文件的规定）8文件执行时间问题。本文件没有明确执行时间，但是由于该文件是对执行《企业所得税法》的解释，一般认为应该在2008年开始实施。例如：某企业2008年一次性收取10年租金100万元，2008年一次性作为收入，并且在附表3第5行进行了纳税调增900万元。企业提出进行追溯调整，即：2008年应确认收入100万元，多确认的900万元应该退税，企业不要求退税，而是要求在2009年抵顶税款800万元25，而以后每年度不再做纳税调减，即：实现了资金的时间价值。如果不要求抵顶，则每年调减100万元的所得额。
二、关于债务重组收入确认问题企业发生债务重组，应在债务重组合同或协议生效时确认收入的实现。1、债务重组业务往往有一个过程，到底是按照债务重组股东大会批准的时间，还是按照合同生效时间，过去并不明确。本文件明确了债务重组的纳税义务发生时间。2、对纳税义务发生时间的规定，具有现实意义。
f（1）2003年3月1日之前发生的债务重组，不纳税。（国税函【2009】001号文件。（2）2008年1月1日以后，根据财税【2009】59号文件，债转股债务重组所得r