清学转换或抗病毒治疗获得病毒学应答的患者，其免疫功能有所恢复，提示抗病毒治疗序贯免疫治疗或许能够增加病毒清除的机会。
对HBV的免疫应答可能带来负面效应。过度激活的免疫应答可介导爆发性肝炎或伴随着转氨酶突然升高的慢乙肝急性加重。
部分患者随着转氨酶升高，HBVDNA水平下降并随之出现HBeAg血清学转换（意味着对感染肝细胞实现成功免疫清除），而部分在转氨酶升高的同时仅有暂时HBVDNA的下降，则意味着免疫清除无效。转氨酶突然再次升高增加发生肝硬化及肝细胞癌的风险。除了细胞免疫介导的肝内反应，体液免疫应答的不平衡导致循环免疫复合物的形成也导致了一系列肝外表现，主要有血管球性肾炎及包括结节性多动脉炎在内的血管炎。病毒学
HBV属于嗜肝DNA病毒科，是一个部分双链DNA病毒，全长约3200个碱基对。HBV的转录模板为cccDNA，主要以微小染色体的形式存在于肝细胞内，保持cccDNA池的稳定对病毒的持续感染非常重要。HBV的复制涉及将前基因组RNA逆转录为HBVDNA，而逆转录酶易错配且突变率高。HBV进入肝细胞的受体是钠牛黄胆酸多肽。
HBV最常见的突变包括产生一个终止密码子的前C区域1896位点的单突变，以及减少了前C区RNA转录的BCP区17621764双突变。这些突变或终止或下调HBeAg的产生，但不影响病毒的复制能力，导致了HBeAg阴性的慢性HBV感染。前C及BCP启动子突变可单独出现，也可一起出现。
这些HBeAg阴性突变的地理分布与它们相关的基因型有关。HBV病毒至少可以被分为AJ10个基因型。A基因型在北美、北欧及非洲常见，B和C基因型主要分布在亚洲，而D基因型主要分布在地中海国家、中东及印度（图1）。HBV基因型可以影响疾病的预后及其对干扰素的应答。自然史
急性HBV感染是否出现症状及其临床结局取决于感染时的年龄。婴幼儿感染时大多没有症状，而接近70的成年人有亚临床或无黄疸型肝炎症状，30表现为黄疸型肝炎。不足1的成人急性HBV感染可能进展为爆发性肝炎，不进行肝移植的死亡率接近80。
在HBV暴露后210周，血清即可检出HBsAg，而在46个月时才有临床症状的表现及转氨酶的升高。对于恢复的患者，抗HBs往往在HBsAg血清学清除前后数周出现（图3）。HBsAg持续阳性超过6个月被定义为慢乙肝感染。
f图3慢乙肝自然史示意图在婴儿期及儿童早期获得的HBV感染主要表现有HBeAg阳性、病毒载量极高
（107IUml）、转氨酶正常、肝组织学炎症和纤维化程度轻微（图3、表3），同时HBsAg的水平也很高（105IUml）。
这一阶段可持续2r