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SNP检测方法(百度知道)现在SNP的常用检测方法主要有:Taqma
法、质谱法、芯片法、测序法。Taqma
法:准确性高,适合于大样本、少位点,价格比较贵;质谱法:准确性高,适合于大样本、多位点(能检测25个位点);芯片法:准确性较低,适合于超多位点分析;测序法:非常准备,但是价格也非常的高,但是对于少样本、超多位点还是非常好的选择。
人们对SNP的研究方法进行了许多探索和改进。SNP分析技术按其研究对象主要分为两大类即①对未知SNP进行分析即找寻未知的SNP或确定某一未知SNP与某遗传病的关系。检测未知SNP有许多种方法可以使用如温度梯度凝胶电泳TGGE、变性梯度凝胶电泳DGGE、单链构象多态性SSCP、变性的高效液相色谱检测DHPLC、限制性片段长度多态性RFLP、随机扩增多态性DNARAPD等但这些方法只能发现含有SNP的DNA链不能确知突变的位置和碱基类别要想做到这一点必须对那些含有SNP的DNA链进行测序。②对已知SNP进行分析即对不同群体SNP遗传多样性检测或在临床上对已知致病基因的遗传病进行基因诊断。筛查已知SNP的方法有等位基因特异寡核苷酸片段分析ASO、突变错配扩增检验MAMA、基因芯片技术ge
echips等。由于人类基因工程的带动许多物种都已开始了基因组的项目并建立了大量数据库比较这些来自不同实验室不同个体的序列就可以检测到SNP。目前可供利用的公开SNP网上资源主要包括①由美国国立卫生研究院Natio
alI
stitutesofHealthNIH提供的主要是与癌症和肿瘤相关的候选SNP数据库httpcgap
ci
ihgovGAI②由NIH开辟的适于生物医学研究的dbSNP多态性数据库httpwww
cbi
lm
ihgovSNP③德国的HGBAS网站提供的人类SNP数据库httphgbasCgrkisei等。另外日本建立了JSTSNP数据库https
pImsutolkyoacjp我国也于2001年底启动了“863”计划进行中华民族基因组SNP系统目录的构建与研究。
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