深铁路、厦漳跨海大桥，以及港区内部集疏运通道等，共同构成了现代化综合立体交通运输网络。因此，厦门海沧保税港区的建设，将增强厦门港口经济的集聚与辐射能力，为北连长三角、南接珠三角以及中西部地区的对外开放，架设了桥梁和通道。
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三、海沧保税港区将促进海峡两岸的经贸合作交流厦门与台湾岛隔海相望，厦门港具有独特的对台航运优势，是海峡西岸对接台湾的枢纽。在有关部门的支持和推动下，厦门港在全面实现两岸海上直航以来，一直努力加强与台湾各港口的联系与交往，就对台航运方面发挥着积极的作用。海沧作为全国最大台商投资区，海沧保税港区也就理所当然的成为台商在大陆投资的最佳选点。海沧保税港区不但是距离台湾最近的保税港区，其距离台湾高雄港仅165海里，货运直航也不到10个小时，而且在对台交流中也肩负着重要使命。将厦门海沧保税港区对接台湾高雄港，能充分地利用高雄港航线资源，台湾的轻工、化工产品等就可以在海沧保税港区聚集后向内陆集散，更有效地承接台湾物流运营商的国际集装箱货物中转，促进并深化两岸的经贸合作交流。2010年5月10日，海沧保税港区管委会与高雄港务局在高雄签署合作意向书，双方决定加强物流产业、海运市场资讯交流，为区内企业提供经贸交流的必要协助。
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