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基因芯片技术r
作者:冯永强阎小君苏成芝r
随着人类基因组(测序)计划(Huma
ge
omeproject)的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展r
越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定r
基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长r
然而怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题r
为此r
建立新型杂交和测序方法以对大量的遗传信息进行高效、快速的检测、分析就显得格外重要了r
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基因芯片(又称DNA芯片、生物芯片)技术就是顺应这一科学发展要求的产物r
它的出现为解决此类问题提供了光辉的前景r
该技术系指将大量(通常每平方厘米点阵密度高于400)探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交r
通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息r
早在八十年代r
Bai
sW等人1就将短的DNA片断固定到支持物上r
借助杂交方式进行序列测定r
但基因芯片从实验室走向工业化却是直接得益于探针固相原位合成技术和照相平板印刷技术的有机结合以及激光共聚焦显微技术的引入r
它使得合成、固定高密度的数以万计的探针分子切实可行r
而且借助激光共聚焦显微扫描技术使得可以对杂交信号进行实时、灵敏、准确的检测和分析r
正如电子管电路向晶体管电路和集成电路发展是所经历的那样r
核酸杂交技术的集成化也已经和正在使分子生物学技术发生着一场革命r
现在全世界已有十多家公司专门从事基因芯片的研究和开发工作r
且已有较为成型的产品和设备问世r
主要代表为美国Affymetrix公司r
该公司聚集有多位计算机、数学和分子生物学专家r
其每年的研究经费在一千万美元以上r
且已历时六七年之久r
拥有多项专例r
产品即将或已有部分投放市场r
产生的社会效益和经济效益令人瞻目r
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基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上r
所以可以一次性对样品大量序列进行检测和分析r
从而解决了传统核酸印迹杂交(Souther
Blotti
g和Norther
Blotti
g等)技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足r
而且r
通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使该技术具有多种不同的应用价值r
如基因表达谱测定、实变检测、多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等r
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1.基因芯片的主要类型r
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目前已有多种方法可以将寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上r
这些方法总体上有两种r
即原位合成(i
situsy
thesis)与合成点样两r
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