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系中特定转录本的数量,表现出极高的灵敏度、精确度和重复性。该技术无需使用酶,无需反转录,也不需要做增,即可进一步减少误差的产生,因此
Cou
ter在表达谱定量分析领域具有无可比拟的优势。应用领域包括基因表达谱研究(个基因分析通量)、小RNA分析、拷贝数多样性分析和帮助二代测序进行后期验证。
14。
PCR扩800
33病人源性直观抗癌药物筛选
随着生物技术的发展和成熟,以及可靠的组学数据和临床数据的大量积累,上述的精准医疗间接方法得以在临床实施。但是由于此方法是基于生物标志物的发现及其在肿瘤发生中的功能及机理的认知,加上大数据基础上的关联模型的建立,因此在可靠性和重复性方面具有很大的挑战性,从而目前应用上有其局限性。鉴于上述原因,笔者提出了利用病人源性细胞和组织来直接筛选抗肿瘤药物的精准医疗方法理念,作为对组学方法的验证和扩展。尤其是通过病人源性3D组织或类器官培养和异种移植PDX模型进行抗癌药物的直接筛选已开始受到重视。
1)二维(2D)细胞培养。作为最早的药物筛选模型仍然被广泛使用于医药行业15。2D细胞培养技术可适用于各种类型的细胞,人类肿瘤细胞很适合于在人为控制的实验室条件生长和维护。然而,在含高水平血清的二维培养平皿中即便是原代细胞的培养,代表着一种过度简单化和脱离机体的生物学系统。这些细胞在保存其来源组织的基因型和表型等方面,具有其局限性。
2)体外组织培养(
histoculture)。基本原理包括癌组织的活检、将活组织块在特定培养介质中三维生长、抗癌药物的加入和
疗效评估16。后者可通过不同的肿瘤化疗药敏试验进行,如常见的四甲基偶氮唑盐比色法(
MTT法)。此培养法能够保持肿瘤的组织
病理和细胞微环境(microe
viro
me
t)等特性,更接近体内的环境生长条件,不失为一种快速、简易筛选抗癌药物的体外方法。
3)病人源性异种移植。它是直接将患者的临床癌症组织转移到裸鼠中建立的动物模型。肿瘤组织能保留患者完全相同的遗传和
形态学的特征,为药物筛选和新药开发提供了很具预测力的个性化抗癌药物疗效检测平台。但此法周期长,成本昂贵,缺少关键的免疫因素影响,而且很难高通量17。
4)三维类器官培养(3Dorga
oidculture)。肿瘤患者对抗癌疗法,如化疗的临床反应有很大的个体差异,其原因被认为除
遗传差异和肿瘤异质性外,机体和肿瘤之间形成的微环境也很关键。越来越多的证据表明,肿瘤的发展和对治疗的反应是由肿瘤微环
境进行调控的。在此领域中有不少r
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