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丙型肝炎病毒基因分型的研究进展
丙型肝炎病毒是输血后感染肝炎常见的一种病毒,目前其分为6型,其亚型已经超过100个,由于其复制依赖的酶缺乏校对功能,所以易发生突变,这也是丙型肝炎病毒基因组分型的基础。其分型的命名因为采取的标准及使用的分析方法不一样也有不同的命名系统。丙型肝炎病毒基因的检测方法很多,但是不简便经济,而且其与丙型肝炎有很大的关系。
标签:丙型肝炎病毒;基因分型;进展研究在如今生活中,除了乙肝是常见肝病外,丙肝患者的比例越来愈高,究其原因主要是人们对于丙肝的感染途径不了解,未对丙肝给予足够的重视。其传播途径主要有:①输血及血制品,尤其是反复输血及使用血制品者,据统计,输血后肝炎70以上是丙型肝炎。②不正规注射。③伤口未护理。④性接触。⑤母婴传播。在这几种传播途径中,①④⑤最易感染丙肝。在日常生活中,人们需要采取相关防范措施,以免感染丙肝。
1HCV的结构
HCV的RNA大约有9500-10000bp组成,其5′非编码区有319341bp,3′非编码区有2755bp。在5′非编码区下有一开放阅读框(ORF),其基因排列顺序为5’CE1E2p7NS2NS3NS4NS53,能编码多聚蛋白前体(一长3014个的氨基酸)。经宿主细胞及自身蛋白酶作用可裂解成三种结构蛋白,其分别为核心蛋白、糖蛋白、非结构蛋白三种。HCV基因标记有很多种,如GP72,其基因标记为E2NS1。其糖蛋白能产生抗HCV的中和作用。还有NS2、NS3、NS4等基因标记。
NS2和NS4的功能可能与细胞膜紧密结合在一起。NS3参与解旋HCVRNA分子,具有螺旋酶活性,以辅助RNA复制,NS5参与HCV基因组复制,依赖于RNA的聚合酶活性。
2HCV的分型及地理差异
目前HCV分型尚无统一的定论,这是因为在研究的过程中采取的技术及研究的位置不一致,因而出现了很多基因分型,这些基因分型没有同一的标准。综合各个国家的研究结果,大致上可分为6型,其亚型很多。而且HCV感染有很大的地域差异。比如欧洲国家主要是HCVⅠ型感染,亚洲国家主要感染Ⅱ型。在我国,很多患者为Ⅱ型感染,其次为Ⅲ型感染,但是有些地区Ⅲ型感染率超过Ⅱ型感染率,从这里来看,丙肝感染并不是一成不变的,还跟地区有很大的关系。
3HCV基因检测方法
关于HCV的检测方法有很多,主要有分子学方法和血清学方法两种,其中分子学方法占主要方面,其有:①直接测序法;②限制性片段长度多态性分析法;③特异性探针杂交法;④基因芯片;⑤遗传系统进化树分析方法;⑥型特异性引
f物PCR法;⑦荧光共振能量转移探r
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