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分子生物学软件简要功能介绍
在进行分子生物学研究时,常需要用到各种计算机软件。这些软件种类不少,功能大致相同,到底使用哪个,其实可根据各人的使用习惯来选择。下列的软件,大部分可在网上找到全功能的版本或各种演示版或试用版,只要以软件名为关键词用搜索引擎搜索就可以了。网上也有此类各种软件的总结。下面为此类软件的简单介绍:
1三维分子类5生化教学9序列综合分析13数据处理17化学绘图21RNAa
alysis
2DNA分析6生化工程10进化树分析14检索与阅读18化学应用22在线引物设计
3RNA分析7序列格式转换11质粒绘图15基因芯片19在线综合工具
4蛋白质分析8引物分析12图像处理16其他功能软件20在线蛋白工具
1三维分子类RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构RasTop:为RasMol271的图形用户界面软件CHIME:直接在浏览器中观看3D分子MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件raswi
exegz:rasmolwi
2701rasmol新版本及汉化版本CrystI
fo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构
fPDViewer:PDB格式文件的查看程序WeblabViewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子WeblabViewerPro:三维分子浏览工具ICMLite:三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能VMD:三维分子浏览工具,可以进行动态显示CN3D:3D分子结构观察软件WPDB:PDB文件检索显示分析软件DTMM:三维分子模型显示、编辑与构建程序Mole:高性能的大分子三维图形显示计算工具gope
mol:显示并分析分子结构及其特性POVRayv:生成三维图像工具软件MolPOV:将PDB文件转化为POV格式文件的软件Mol2Mol:分子文件格式转换软件PovChem:将PDB文件转化为POV格式的文件Ortep3forWi
dows:生成分子的热椭圆形点图PLATON:通用结晶学软件工具
fMage:读取并演示Ki
emage格式文件的专用软件Preki
:将PDB格式文件转换为Ki
emage格式文件
SwissPdbViewer:PDB文件显示与分析软件DINAMO:蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2Lite:查看PDB格式文件的免费软件StrukEd:化学分子编辑与三维模型生成软件JMVC:使用JAVA技术编写的三维分子查看器ReView:读取及分析XYZ格式三维分子文件Oscail:用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包Moili
:分子构建与观察软件Ti
ker:与Moili
配套的DOS下的分子设计建模Biodesig
er:免费的分子建模与显示软件MoluCAD:全功能的分子建模与显示工具软件ViewerActivexCo
trol:三维分子显示控件Marvi
View:JAVA语言编写的化学分子二维与三维显示程序ACD3DViewerforISIS:免费的ISISDrawr
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