PLC，因此仅能使用小体积注射，降低了测定灵敏度（尽管使用更高极性的有机流动相提高离子化作用可以在一定程度上得到补偿）。HILIC也能显著产生更宽色谱峰比RPLC，导致更低峰容量和峰的分辨率更大程
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f度上依赖质谱。
尽管这些缺点，HILIC已经发现更多用途用于分析代谢显型样品，例如，尿液。HILIC已经被用于结合MSMS发展多分析检测被称为靶向代谢轮廓模式。HILICMS、MS使用一个氨基化合物的UPLC柱子导致定量检测140极性代谢
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f产物在单一注射酒或水果提取物。比较UPLC型HILIC和RPUHPLC对于大鼠尿液泌尿轮廓已经展示，表明两种方法都能分离不同显型，但对于那种方法，不必惊讶，这种检测依靠不同的生物标记物。其他的研究尿液中极性代谢物的色谱法，应用HILIC的方法，水相NPLC和RPLC表明对于两性离子，评价HILIC柱子能给出更好的结果，同时一个最近研究也评估一定范围内。相的发现HILIC在DIOL柱子得到最好的效果。另外，应用结合HILIC和RPLCMS方法已经发展为轮廓更加广泛的脂类和以碳中心的代谢菌的代谢产物和癌细胞和人类血浆。在同样的方法，如Tki
dt等。比较HILIC和RPLC对于植物代谢组学。图五表明一个典型HILIC分离尿中的代谢物，分析时间为20mi
。色谱图表明相关色谱较宽的峰是HILIC的特征。对比于RPLC，但此方法表明良好保留时间重现性（CV17）和一个平均CV为14达到信号强度超过被200样品分析。
LCMS分析法使用HILICMS分析尿液样本源自在大鼠中半乳糖胺的肝
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f毒性的研究，表明了一个清晰的统计学的不同在模型组和给药组，并且统计学的角度揭示大量尿酸。N乙酰葡萄胺和tyrami
一起极大增加了一定量的2氧代葡萄糖盐在大鼠中。然而，同时广泛使用HILIC并不代表对极性化合物是通用的，结果一定范围内，不得不探索其他选择。固定相例如石墨化碳，同时高保留对于极性化合物和提供更有效的分离对于磷酸核糖核苷酸和核糖核酸出现保持一些分析物不可逆（例如丙酮酸盐、乳糖、果糖、16biphosphate。二氧化硅氯化物固定相已经被建议对于极性代谢物，但是，仍然很少它们应用的例子。目前，对于极性、阴离子代谢物大部分广泛应用的方法是IPC，一般使用三丁基胺作为IP试剂，同时大多数发表的例子已经发展为靶向分析例如中心碳代谢物，它们对一般的污染损害系统极性阴离子化合物也有很好的表现并且因此同等适用于非靶向分析。结合这种方法的主要困难就是IP试剂此后阻碍了它是适用于由于离子抑制的正离子电喷雾。改变IP试剂在系统中所有途径是一r