域。信号肽切割位点的3和1位为小而中性氨基酸。
推荐使用Sig
alP软件20版（httpwwwcbsdtudkservicesSig
alP20）对PDCD5N端序列进行信号肽分析。Sig
alP20根据信号肽序列特征，采用神经网络方法或隐马氏模型方法，根据物种的不同，分别选择用真核和原核序列进行训练，对信号肽位置及切割位点进行预测。信号肽切割位点预测用Yscoremaximum来判断，对是否分泌蛋白用mea
Sscore来判断：如果mea
Sscore大于05，则预测为分泌蛋白，存在信号肽，但II型跨膜蛋白的N端序列可能被错误预测为分泌蛋白的信号肽。
方法：输入待分析的蛋白序列，如为原核基因选择原核训练集，否则选择真核训练集。
3、亚细胞定位预测
亚细胞定位与蛋白质的功能存在着非常重要的联系。亚细胞定位预测基于如下原理：（1）不同的细胞器往往具有不同的理化环境它根据蛋白质的结构及表面理化特征选择性容纳蛋白。（2）蛋白质表面直接暴露于细胞器环境中它由序列折叠过程决定而后者取决于氨基酸组成。因此可以通过氨基酸组成进行亚细胞定位的预测。
推荐使用PSORT（httppsort
ibbacjp）II软件对PDCD5蛋白的细胞内定位进行预测。PSORT将动物蛋白质定位于10个细胞器：（1）细胞浆，（2）细胞骨架，（3）内质网，（4）胞外，（5）高尔基体，（6）溶酶体，（7）线粒体，（8）胞核，（9）过氧化物酶体（peroxisome）和（10）细胞膜。
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