种苗，在农事操作中尽量避免病毒经器械等传播，加强栽培管理，及时拔除初侵染病株，销毁病株残体。1、严格封锁疫区，加强调运和产地检疫。对疫情发生区、受威胁区，立即采取隔离预防、封闭消毒等措施封锁疫情发生区，严防疫情传播扩散。不得将染疫的农作物、农产品、田间铺垫物、工具及大棚材料等物品运出疫区。不能随便引种，更不能从病区引种和病地采种，严格遵守检疫制度。对从外地调运的葫芦科的种子、种苗，必须附有《植物检疫证书》。2、田间处理：疫区瓜藤、田间铺垫物全部清理焚烧，瓜果进行深埋；对土壤灌深水后亩撒100公斤生石灰进行消毒，工具及大棚用10甲醛溶液喷雾后予以封闭消毒。3、合理轮作倒茬，减少病毒毒源。黄瓜绿斑驳花叶病毒病是以侵染葫芦科植物为主的病害，一般与非寄主作物实行2年以上的轮作倒茬。同时，加强田间管理，增施肥料，增强抵抗力，促进植株生长，减轻毒源和损失。
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