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称:基于数据挖掘的β淀粉蛋白对海马神经元离子通道的调控生物信息学数据研究
2、拟开展研究课题的国内外研究现状及选题意义:随着科学技术的飞速发展,经济和社会都取得了极大的进步,与此同时,在各个领域
产生了大量的数据,如何从这些数据中发现有价值的知识及规律,成为目前理论与实践研究的热点与难点。与此同时,生命科学技术的快速发展也产生了大量的生物数据,单纯地利用传统的生物实验方法将很难快速且全面的处理如此多生物数据,从而必然制约了生命科学及制药工程的快速发展。在这种情况下,生物信息学应运而生。生物信息学是一门生物学与信息科学交叉而形成的年轻学科,旨在运用信息学、物理学、化学、数学、计算机科学、系统科学的理论和方法来研究生物系统和生物过程的信息量和信息流,在已有数据的基础之上发现相应的规律和知识并进而用来进一步指导与解释生物实验与生命现象,加速对生命本质特征的认识。生命科学的信息化是21世纪生命科学最重要的特点与发展趋势,生命科学正在成为一门信息科学,因此,在数据挖掘及生物信息学理论与方法上进行深入的研究与探索显得非常有必要。
膜蛋白是一种非常重要的蛋白,占人体蛋白总数的约13,到目前为止,在PDB(Protei
DataBa
k)的结构数据库中只有不到1的资料是膜蛋白的结构数据。这不是说明膜蛋白的结构不重要,相反,膜受体蛋白非常重要,它们是大部分药物的作用靶点。但由于一直缺乏很好的膜蛋白大量可溶性表达技术,因此也就得不到足够的蛋白结晶体用于结构分析。即使是结构基因组学这项旨在分析每一个蛋白家族结构的学科,也因为存在技术难题而没有将研究重点放在膜蛋白上。
膜蛋白的主要功能之一是离子通道,我们的认知、感觉、情绪等的产生都是由于这些通道在不停地开关,所以,膜蛋白对人体的重要性是不言而喻的。绝大多数疾病都是由于某一特定的膜蛋白不足引起的,现在市场上销售的80的药物都集中在膜蛋白上。因此,研究膜蛋白的序列特征以及其三维结构对于了解膜蛋白的功能起着重要的作用,已经成为结构生物学中的研究热点,但同时由于膜蛋白不溶于水的特性也使得生物实验方法求解膜蛋白结构非常困难,这为利用计算方法从序列预测膜蛋白拓扑结构提出了挑战及崭新的课题。蛋白在细胞中的位置信息与其功能特性是密切相关的,甚至即使我们知道了一个蛋白的功能特性,了解该蛋白在细胞中行使功能的位置也是非常重要的。例如,细胞核包含了细胞的遗传因子DNA,控制着细胞的r
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