,所以PMSF应该在使用前现加,其他抑制剂成分可以在水溶液中稳定5天。各种成分在工作液中的终浓度:
TrisHCl50mMpH74NP401去氧胆酸钠:025NaCl150mMEDTA1mMPMSF1mM抑蛋白酶肽,亮抑酶肽胃蛋白酶抑制剂各1956gmlNa3VO41mMNaF1mM
三、实验流程:
(1)转染后2448h可收获细胞,加入适量细胞裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂),冰上裂解30mi
细胞裂解液于
f4176C,最大转速离心30mi
后取上清;(2)取少量裂解液以备Wester
blot分析,剩余裂解液
加1956g相应的抗体加入到细胞裂解液,4176C缓慢摇晃孵育过夜;
(3)取10956lprotei
A琼脂糖珠,用适量裂解缓冲液洗3次,每次3000rpm离心3mi
;
(4)将预处理过的10956lprotei
A琼脂糖珠加入到和抗体孵育过夜的细胞裂解液中4176C缓慢摇晃孵育24h,使抗体与protei
A琼脂糖珠偶连;
(5)免疫沉淀反应后,在4176C以3000rpm速度离心3mi
,将琼脂糖珠离心至管底;将上清小心吸去,琼脂糖珠用1ml裂解缓冲液洗3-4次;最后加入15956l的2215SDS上样缓冲液,沸水煮5分钟;
(6)SDSPAGEWester
blotti
g或质谱仪分析。通过免疫共沉淀确定结合蛋白1.用磷酸盐缓冲液洗30块10cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2.将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中,在微量离心机上4℃以最大速度离心15mi
。3.收集上清(约30ml)并加入30956g的适当抗体,4℃摇动免疫沉淀物1h。4.加入09ml的蛋白质ASepharose悬液,4℃摇动免疫沉
f淀物30mi
。5.用含900mmolLNaCl的NETN洗蛋白ASepharose混合物,再重复洗5次。最后,用NETN洗一次。6.吸出混合物的液体部分。加入800956l的1215SDS胶加样缓冲液到球珠中,煮沸4mi
。7.将样品加入到大孔的不连续SDSPAGE梯度胶中,在10mA的恒定电流下电泳过夜。8.通过考马斯蓝染色观察蛋白质泳带。9.从胶上切下目标带,将其放到微量离心管中,用1ml50乙腈洗两次,每次3mi
。10.用胰蛋白酶消化胶中的蛋白质,再将肽电洗脱。11.通过窄孔高效液相色谱分离肽。将收集的肽在ABI477A或494A机器上进行自动Edma
降解测序。
四、注意的问题:
(1)细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用,多采用非离子变性剂(NP40或Trito
X100。每种细胞的裂解条件是不一样的,通过经验确定。不能用高浓度的变性剂(02%SDS,细胞裂解液中要加各种酶抑制剂,如商品化的cocktailer。
f(2)使用明确的抗体,可r