自己无罪的证据就判定被告人有罪。第三，现有的刑事诉讼法吸收了无罪推定中“疑罪从无”的原则，当案件中没有充足的证据证明被告人是罪犯时，控诉方可以不予起诉。法院在审理案件时也要指出由于证据不足或指控罪名不成立的原因做出无罪判决。无罪推定思想在我国刑事诉讼法中的吸收和应用是我国人权理念上的一大进步。
3、改革和完善刑事辩护和代理制度
犯罪嫌疑人能否有效的行使辩护权是刑事诉讼法是否科学完善的重要衡量标准，而犯罪嫌疑人的辩护权主要通过律师的法律援助来实现。我国原先的刑事诉讼法规定，律师可以在开庭审批前的七天参与到刑事诉讼过程中。修改后的刑事诉讼法则将这一时间提前到了案件的侦查阶段，也就是案件转移至审查起诉的阶段。这这一阶段，律师可以全面的参与到被告人的辩护和诉讼中。受被害人委托的律师还可以对案件侦查过程中的资料进行复印和摘抄，还可以在嫌疑人被拘留的过程中对嫌疑人进行探视。这些调整都体现了我国对被告人人权的尊重和保障。
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此外，我国在加强被害人辩护制度的同时，也为被害人提供了较为完善的法律援助。根据我国《刑事诉讼法》的规定，当被告人由于经济困难或其他原因无法对其自身进行辩护时，人民法院可以为被害人指派提供法律援助的律师为其进行辩护。当被告人是残障人士或未成年人且有可能被判处死刑时，若被害人没有辩护律师，人民法院有义务承担法律援助的责任，为被告人指派辩护律师。联合国的公约中也包含了相似的内容：被告人有权利出庭为自己辩护或选择相应的法律援助为自己进行辩护；若被害人没有选择法律援助，应当告知被害人享有接受法律援助的权利；在司法案件中，当被害人接受了法律援助而没有偿还法律援助相应的费用时，这部分费用不需要被害人自己承担。我国确立的法律援助制度不仅体现了对被告人的保护，还体现了我国对所有公民人权的尊重，有助于促进我国的刑事诉讼法向着更加科学完善的方向发展。
4、改革我国刑事审判方式，保障有罪的人受到公正的审判和惩罚
公正合理的审判是确保社会秩序的根本保障，这也是联合国人权保障制度中所强调的。《世界人权宣言》中明确规定，在任何一个刑事案件中，任何部门和个人都必须严格按照法律法规进行公开的审讯。我国的刑事诉讼法中也十分重视公正审判的问题，并将刑事诉讼过程中实现人权的保障作为最高的原则和目标。为此，在审判的过程中需要确保合议庭对案件具有独立的审判权，只有当出现难以r