1540bp,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,其可变区序列因细菌不同而异,恒定区序列基本保守,所以可利用恒定区序列设计引物,将16SrDNA片段扩增出来,通过高通量测序利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
cDNA:compleme
taryDNA,互补脱氧核糖核酸,与RNA链互补的单链DNA,以RNA为模板,在反转录酶的作用下所合成的DNA。
SmallRNA:生物体内一类高度保守的重要的功能分子,其大小在1830
t,包括microRNA、siRNA、s
RNA、s
oRNA和piRNA(piwii
teracti
gRNA)等,它的主要功能是诱导基因沉默,调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。以miRNA为例介绍它们的功能:miRNA与RNA诱导沉默复合体(RNAi
ducedsile
ci
gcomplex
fRISC)结合,并将此复合体与其互补的mRNA序列结合,根据靶序列与miRNA的互补程度,从而导致靶序列降解或干扰靶序列蛋白质的翻译过程。
SD区域:Segme
tduplicatio
,串联重复是由序列相近的一些DNA片段串联组成。串联重复在人类基因多样性的灵长类基因中发挥重要作用。
Ge
otypea
dphe
otype:基因型与表型,基因型是指某一生物个体全部基因组合的总称;表型,又称性状,是基因型和环境共同作用的结果。
基因组:Ge
ome,单倍体细胞核、细胞器(线粒体、叶绿体)或病毒粒子所含的全部DNA分子或RNA分子。
全基因组de
ovo测序:又称从头测序,它不依赖于任何现有的序列资料,而直接对某个物种的基因组进行测序,然后利用生物信息学分析手段对序列进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。
全基因组重测序:对已有参考序列(Refere
ceSeque
ce)物种的不同个体进行基因组测序,并以此为基础进行个体或群体水平的遗传差异性分析。全基因组重测序能够发现大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CopyNumberVariatio
,CNV)、插入缺失(I
Del,I
sertio
Deletio
)、结构变异(StructureVariatio
,SV)等变异类型,以准确快速的方法将单个参考基因组信息上升为群体遗传特征。
转录组:Tra
scriptome,是指特定生长阶段某组织或细胞内所有转录产物的集合;狭义上指所有mRNA的集合。
f转录组测序:对某组织在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA进行测序,获得特定状态下的该物种的几乎所有转录本序列信息。通常转录组测序是指对mRNA进行测序获得相关序列的过程。其根据所研究物种是否有参考基因组序列分为转录组de
ovo测序(无参考基因组序列)和转录组重测序(有参考基因组序列)。
外显子组:Exome,人类基r