分立的监督管理机制，内部治理机制虚化，导致内部监督力度不够，内部控制制度得不到应有的遵守。在我国证券公司大多数是以国有资本为投资主体，吸引部分社会资本组建起来的，因此总体上属于国有企业或国有控股企业，一股独大，董事不“懂事”的情况比较严重，且董事会对经理层缺乏有效的约束，出现少数大股东控制董事会进而操纵股东大会，使得股东会、董事会、监事会和经营者相互之间的分权和制衡机制不能有效运行，导致许多公司内部集所有权、决策权、执行权和监督权于一身，其组织结构之间存在一系列有悖于市场经济要求的问题，如上下级之间关系不顺，部门之间职责不清以及信息沟通渠道不畅等，规定的制度失去了严肃性和约束性，使得管理效率低下。
3证券公司高管进行违规经营，资金监管力度不够
我国的证券公司起步较晚，规模普遍偏小，资本金严重不足，经营管理水平较差，在缺乏合理的融资渠道和有效法人治理结构的情况下，证券公司经营者容易利用自身优势和代理客户资金管理的便利，挪用客户交易结算资金，操纵市场，违规牟利，损害了股东和投资者利益。通过对那些挪用客户保证金公司的核查发现，忽视经营风险，过度挤占挪用客户保证金，致使正常的交易结算都难以运转是其走向衰败的一个主要原因。
证券行业本身是个高风险的行业，在经营过程中，证券公司会面临各种各样的风险，如操作风险、市场风险、流动风险等。然而当前有些证券公司高管在对待风险态度和控制风险的方式上，意识薄弱，风险控制技术和手段相对滞后。为了追求高收益，一些公司过度冒险，将负债风险和破产风险交由股东去承担，最终导致了公司和股东利益都受到重大损失。
4内部会计控制制度不完善
公司内部会计控制侧重于事中和事后控制，而对经营风险和财务风险的事前风险预测和控制较少。有些证券公司没有按照中国证监会《证券公司内部控制指引》的要求来建立起风险防范的三道防线，财务监督也不健全。表面上看，这些公司的会计核算工作很完整、规范，有关财务负责人也能说出条条道道，细查发现其财务管理、财务监督基本处于空白状态。有些证券公司对多年来形成的大量应收款项不跟踪，不催收，也没有提坏账准备，甚至各营业部相互之间的往来款项也多年不做清理。
综上所述，公司经营失败、违法违规经营的问题大部分可以归结到其内部控制的失缺或失效。
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二、加强我国证券公司风险内部控制的措施
1提高对加强内部控制在风险管理中作用的r