生物信息学研究概述
甄卓
【摘要】随着人类基因组计划的完成，不断积累的巨量的生物学数据和快速发展的信息学技术，给后基：因组时代的生物信息学研究带来了新的挑战。该文对生物信息学研究内容进行了描述，分别就其研究任务和研究方向作了区别讨论，比较了国内外的研究发展情况和差距。并对生物信息学的发展做了展望。【关键词】：生物信息学
前言
生物信息学bioi
formatics是在生命科学、计算机科学和数学的基础上逐步发展而形成的一门新兴交叉学科，是为理解各种数据的生物学意义，运用数学与计算机科学手段进行生13物信息的收集、加工、存储、传播、分析与解析的科学。由于历史原因，有的研究者也使用计算生物学computatio
albiology或计算分子生物学computatio
almolecularbiology等不同的术语。在后基因组时代，生物信息学的研究内容主要可分为两个重要组4成部分：基因组信息学和蛋白质组信息学。后基因组时代，除了继续序列和结构分析外，5更多的研究力量则投入到功能分析，也就是分析研究遗传型到表型的过程。随着生物信息学的发展，如何构建新的生物数据库，如何整合现有的数据库或生物数据，如何开发生物数据软件工具，如何应用于工农医药方面的研究等，是直接摆在我们面前的问题。
1生物信息学研究任务
生物信息学研究一方面是对海量数据的收集、整理与服务；另一方面是利用这些数据，从中发现新的规律。具体地讲，生物信息学是从基因组DNA序列信息分析人手，找到基因组序列中负责蛋白质和RNA基因的编码区；同时，阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言规律；在此基础上，归纳、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据，从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。另外生物信息学还利用基因组中编码区的信息进行蛋白质空间结构的模拟和蛋白质功能的预6测，并将此类信息与生物体和生命过程的生理生化信息相结合，阐明其分子机理。
2生物信息学研究方向
21序列比对生物学中的序列是指核酸或氨基酸序列而序列比对的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。两个序列的比对现在已有较成熟的动态规划算法，以及在此基5础上编写的比对软件包BALST和FASTA。主要包含两个序列比对和多重序列比对。不同物种间的基因组比对既能够解释和预测他们蛋白质功能的相似性又能够揭示不同物种间的联系。22序列分析序列分析主要是获知DNA序列对应的基因r