产物。通过比对不同的序列,我们能够发现片段的顺序,并且co
tigs能被添加、删除、重排列来形成新的序列。
Phyloge
etictree:系统发生树又称为演化树(evolutio
arytree)是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树,是一种亲缘分支分类方法。在树中,每个节点代表其各分支的最近共同祖先,而节点间的线段长度对应演化距离(如估计的演化时间)。它用来表示系统发生研究的结果,用它描述物种之间的进化关系。
I
SilicoClo
i
g:电子克隆是近年来发展起来的一门基于表达序列标签(ESTs)的快速克隆基因的新技术,其利用种子序列从EST及U
iGe
e数据库中搜索相似性序列,进行拼装、检索、分析等,以此获得目标基因的全长cDNA,在此基础上也能够实现基因作图定位。
二、问题思考1、生物信息学这门学科是如何发展起来的?答:生物学数据爆炸式增长
生物大分子数据库相继建立
f生物技术与计算机技术并行飞速发展I
ter
et的广泛应用人类基因组计划(HGP)的推动生物信息学的产生是生命科学发展的必然。2、举例说明生物信息学的主要应用?答:a获取各种生物的全基因组及其他数据b新基因发现c单核苷酸多态性分析d基因组中非编码区域的结构与功能e从基因组水平研究生物进化及其他遗传语言的可能f全基因组的比较研究g基因功能预测h遗传疾病的研究以及关键基因鉴定i蛋白质组学研究j新药设计和定向化酶k生物芯片3、为什么说生物信息学是大规模研究生命科学的利器?答:生物信息学主要是一门研究生物学系统和生物学过程中信息流的综合系统学科,是综合运用生物学、数学、物理学、信息科学以及计算机科学等诸多学科的理论方法,以互联网为媒介、数据库为载体、利用数学和计算机科学对生物学数据进行储存、检索和处理分析,并进一步挖掘和解读生物学数据。目前,其核心是基因组信息学,包括基因组信息的获取、处理、存储、分配和解读。还包括:蛋白质空间结构模拟、预测和药物分子设计;软件开发和方法学研究。未来,生物信息学将进一步揭示生命系统的复杂性、遗传语言、基因表达谱、基因组、蛋白质组、代谢组、细胞信号组、系统生物学等等。因此,生物信息学是大规模研究生命科学的利器。4、生物信息学涉及的生物大分子信息有哪些?答:涉及的有:1)核算序列DNA包括:基因组序列、基因序列、cDNA、EST、碱基修饰、DNA功能模块位点如启动子、剪接体、表达调控位点等。2)蛋白质Protei
包括:氨基酸组成、氨基酸序列、理化性质、原子r