一步一步教你使用NCBI查找DNA、
mRNA、cDNA、Protei
、promoter、引
物设计、BLAST序列比对等
最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Parto
e如何查找基因序列、mRNA、PromoterParttwo如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Partthree运用STS查找已经公布的引物序列Partfour如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性
特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充
Firstofall，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤
1．打开Mapviewer页面，网址为：httpwww
cbi
lm
ihgovmapviewi
dexhtml在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：
f2．点击“GO”出现如下页面：
3．在步骤二图示的右下角有一个QuickFilter下面是让你选择的几个复选框，在Ge
e前面的小方框里打勾，然后点击Filter出现下图：
f说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。尽管你分别点击后，序列代码、序列代码等有所差异，但碱基基本一致，不影响大家研究分析序列。现在普遍采用的是最上面的那个序列，这一条是世界范围的生物科学家用计算机合成的一个序列。我也推荐大家使用这个序列。
4．点击上述三条序列第一条序列（即refere
ce）对应的