类资源调查和武夷山自然保护区鱼类补充调查，1990年1995年开展了鸟类区系调查，19961997年进行GEF项目野生动物本底调查，20082009年“中国福建武夷山生物多样性研究信息平台”项目对武夷山自然保护区开展了生物科考补充调查，进一步摸清了保护区本底状况，本次调查发现蛇雕、白腰雨燕等4个鸟类新记录种和刺鳅、暗鳜等5个鱼类新记录种。
（一）森林植被
根据《中国植被区划》，武夷山自然保护区属亚热带常绿阔叶林区域，中亚热带常绿阔叶林地带，浙、闽山丘甜槠（Casta
opsiscyrei）、木荷（Schimasuperba）林区。区内自然环境的多样性，发育着多种多样的植被类型，常绿阔叶林是本区地带性森林植被；此外，还有针、阔昆交林，暖性针中林，毛竹林、常绿、落叶阔叶混交林，中山矮曲林，中山草甸及人工林共8个植被类型，65个群系组，160个群丛组。区内还有21070hm2原生性森林植被未受到人为破坏，是亚热带东部地区森林植被保存最完好的区域。在众多的森林植被类型中，小叶黄杨Buxussi
icavarparvifolia、野茉莉Styraxjapo
icas林、三尖杉
fCephalotaxusfortu
ei、甜槠Casta
opsiscyrei林、闽楠Phoebebour
ei、米槠Casta
opsiscarlesit林、鹅掌揪Liriode
dro
chi
e
se、南方铁杉Tsugachi
e
sisvartchekia
ge
sis林、复羽叶栾树Koelredteriabipi
ata、栲树Casa
opsisfargesii林等群丛，是华东、华中地区极为独特和少有的植被类型，对于生态系统和生物多样性研究，具有重要的科学价值。本区相对海拔最高达1700m，随着海拔的递增，气候、土壤和植被类型明显的垂直分布规律，是中国大陆东南部发育最完好的垂直带谱（详见下图）
本区是中国南方主要林区，活立木蓄积量5621480m3毛竹Phyllostachyspubesce
s立竹数21438万株，有杉木Cu
i
ghamiala
ceolata、樟木Ci
amomumcamphora、闽楠Phoebebour
ei、南方红豆杉（Taxuschi
e
sisvarmairei）等优良和珍贵用材树种。
（二）植物资源
武夷山自然保护区的植物区系，处于泛北极植物区，亚洲东部森
f林植被亚区的东缘，接近古热带植被区，印度马来西亚区的北缘。21、植物种类具有多样性、特异性和变异性
区内有低等植物840种，其中藻类239种，真菌503种，地衣98种；高等植物2466种，其中苔藓73科、191属、431种，18种为中国特有种，94种为东亚特有种；蕨类植物38科、83属248种，分别占有中国蕨类约52种、204属、2600种的73、407和95；裸子植物7科、16属、19种，分别占中国裸子植物约10科、34属、190种的70、47、10；被子植物149科、137r