蛋白分子或者分子片段，一般丌具有抗体活性。临床意义：多性骨髓瘤，巨球蛋白血症，重链病，半分子病，恶性淋巴瘤，良性M蛋白血症血清补体检测补体：存在于人和脊椎动物血清不组织液中一组具有酶活性的丌耐热球蛋白，由三种球蛋白分子组成，包括9种补体成分，补体调节蛋白，B因子等。
RA类风湿性关节炎一般检查炎症指标自身抗体：抗CCP抗体和抗角蛋白抗体RF联合检测免疫球蛋白和补体
SLE系统性红斑狼疮一般检查炎症指标自身抗体：筛选：抗核抗体诊断：dsDNA抗体，抗Sm抗体（标志）抗核糖体抗体
f免疫球蛋白和补体
疾病活动期补体水平下降
SS干燥综合征一般检查炎症指标类风湿因子高自身抗体：斑点型和均质型抗核抗体（SSA，SSB）免疫球蛋白和补体CD4B细胞
强直性脊柱炎AS一般检查ESR加快C反应蛋白增高炎症指标白细胞增加，CRP上升自身抗体：类风湿因子阴性，无紫色呢抗体免疫球蛋白和补体HLAB27
病毒性肝炎血清标志物检查HAV生物学标志HAVRNA粪口传播HBV三种抗原抗体系统有明显地区性，母婴传播率高
HBsAg抗HBs（保护性抗体，空窗期，preS1早期感染标志）HBeAg抗HBe（病毒复制相关，非保护性抗体，恢复期，过去感染，传染性小）HBcAg抗HBc（病毒的核心成分，病毒复制标志物，急性感染病毒复制期（慢性感染），常不HBeAg同时阳性。HBV分子生物学标志：HBVDNA和DNAP是病毒复制最直接地标志不HBV复制和传染性有关的主要感染标志物：HBVDNADNAPHBeAg，HBcAg，preS2，HASR，抗HBcIgM，高滴度抗HBc
fHCV血液传播，基因异质性
无明显地区性
抗HCV非保护性抗体，HCVRNA病毒血症的依据，HCVAg肝细胞中阳性，抗HCV阳性是HCV的诊断依据，IgM阳性病情早期、活动及传染性，IgG出现说明有感染HDV缺陷性病毒，环状单链RNA丌单独病
标志物抗HDIgM，抗HDIgG，HDAg，HDVRNAIgM急性感染HEV抗HEVHEVRNA，粪口传播
肿瘤标志物：TM甲胎蛋白APF肝癌癌胚抗原CEA广谱肿瘤标志物疗效观察预后判断前列腺特异性抗原PSA前列腺疾病，前列腺癌组织多肽抗原TPA非特异性，恶性度检测，妊娠后三个月也有升高鳞状细胞癌抗原SCC鳞癌（宫颈癌，肺癌，鼻咽癌，食道癌）CA153乳腺癌CA125卵巢癌CA199胰腺癌、胃肠癌（消化系统）CA724检测胃癌前列腺酸性磷酸酶（PAP）前列腺癌αL岩藻糖苷酶测定（AFU）原性肝癌神经元特异性烯醇化酶NSE小细胞肺癌，神经母细胞瘤，神经内分泌肿瘤人r