可能达到快速使用直接介绍的方法（直接注入），并且这种基于质荷比分离微粒是足够的，尤其是当使用高效质谱。并且，确实对于直接注入法有一种情况涉及速度和实现的容易程度（对于一些有趣的应用见例子1012）。然而，在不知道样本无目标的分析情况下，这种问题有关于离子抑制和增强效应，并且很难区别在区域同分异构体和立体异构体和同素异形体等，限制了这种方法的价值。这种分离的优点对比更加广泛无靶标的代谢显型的直接注入质谱的例子如图一，借助纳米光设备，比较大鼠血浆直接注入获得的光谱数据，这些数据来源于通过液相质谱联用色谱图显示总结所有的数据。相同的四级杆飞行时间质谱分光仪在正离子电喷雾模式下应用于两个实验。从图一所列举的数据，有一些借助液相质谱分析的重要的更多的离子检测比纳米喷雾注射是更清晰的。通过检测马尿酸盐和质荷比为2971的峰在液相分析中两个大部分强度离子选择性检测的直接注入法是很突出显著的方法。然而液相质谱联用提供了一个更加广泛的轮廓，提高了生物标记物发现
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f的潜能，一旦生物标记物被发现，它是清晰地可以使用直接注入法扫描。首先使用大气压固相分析探针（第一次描述被McEwa
等人）借助超高液相质谱联用定性，通过分析大鼠和狗胆汁来阐明这种方法。随着和是样品的准备，为了分解目前在胆汁中的微团，这种简单方法可以快速检测许多胆酸和辨别从大鼠和狗中得到的胆汁。已经有相关的例子，一个具体疾病轮廓，然后像这样一种方法，随着广泛轮廓首次实行为了确定显型和简单直接注入方法，对于随后的靶向分析可以提供一种途径来支持高通量扫描在临床试验的一个例子。逐渐增长的可利用的离子手性分离联合质谱可能改善代谢轮廓，借助包括一种十分快速分离步骤的直接注入方法提供，但仍然不可能去掉直接注入方法的所有的限制。见例子6，在大鼠血浆的初步的结果依旧表明这种方法在液相分离中的应用的优越性。然而，对于许多靶向方法，合适有效的直接注入方法有明显的优势。
3、结合方法HPLC和它的变形技术代表目前主要分析技术用于代谢轮廓。液相质谱联用方法可能是快速的并且联合分离质谱提供极佳的，即使底物对于各种不同底物种类和物理化学特性是依赖的和灵敏的。液相质谱联用可以使用的样品例如尿液、血清或血浆，经常是极小的样品准备或者依靠原始提取物或化学修正的形式根据气相质谱分析的例子。自从20世纪末期，基于HPLC分析的应用结合电喷雾质谱已经形成了绝r