建议选用不同的绩效评价标准，或者采用共性指标和个性指标相结合的方式。
4绩效评估难点
评价科技企业孵化器的绩效，不能单纯看重产出数量而忽视质量要素，也不能只考虑短期产出或只考虑产出的一个方面。科技企业孵化器的绩效评价需要综合考虑孵化器直接产出质量、间接产出水平以及长期保持高质量产出的潜力。但是有些指标很难用数量指标来测度，如孵化企业质量、企业家成功与否、科技企业孵化器自身水平的提升、孵化器经验的积累等；有些指标又需要在相当长的时期内才可以观测到，如科技企业孵化器对社会和区域经济的贡献、孵化器对科技进步的贡献等。
5绩效评估指标体系的设置建议
（1）强调主导产业的导向作用。孵化器对新兴产业要有引领作用，建议在绩效评估中设置这样的指标，如对主导产业的规划，主导产业的投入、产出情况、产业链间的交流互动等。
（2）强调创业服务软实力。弱化孵化器的硬件载体功能，强化其资源集聚和服务功能，应加强创业服务软实力的指标设计，以保障孵化器的高成长性。如可增加内部制度平台的考核，知识共享制度，创新激励制度等。
（3）从被服务对象（入孵企业的角度）的评价孵化器的服务。现有的考核孵化器内企业的这些指标，不足以体现孵化器的服务。服务最主要的考核标准是被考核对象的满意度，建议可以增加这样的指标，如与孵化企业联系的紧密度，在孵化企业感恩程度；与毕业企业联系紧密度，毕业企业的反哺等。
（4）强调孵化器运营建设的主导因素：团队核心人物的管理能力。人是最主要的因素，天使投资、风险投资很重要的一条投资原则，这个创业团队或者企业的核心人物驾驭能力如何。其实在孵化器也是一样，核心人物如何决定孵化器的发展，建议可以增加领导者凝聚力，领导者组织与管理能力等指标。
（5）强调孵化器的社会功能。我们的创业和硅谷创业的最大差异，在于我们的创业文化，我们对失败的宽容度，我们敢想、敢做的精神跟硅谷不同。孵化器当仁不让的应该承担其创业文化建设和传播的使命，建议可增加服务文化，创新文化，创业文化等指标的考核。
6绩效评价的组织实施
（1）文字材料和现场考核的抽查结合。
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（2）定期组织专家进行评价，并发布评价结果，作为考核的重要依据。
（3）各省级科技行政管理部门，对本辖区评价工作负有指导、监督和协助的职责。
7评价结果及其应用
评价结果分为优秀（A）、良好（B）、合格（C）和不合格（D）四个等级。评价结果为优秀的，在安排相r