核，财务部门对其经费支出进行评价，两部门全部通过的情况下，才能进行科研项目的实施。在执行过程中，科研部门与财务部门要不断地沟通、监督，定期核对科研进度与经费支出情况，防止脱节。
3、建立有效的预算评价指标
目前，我国医院的预算考核指标缺乏统一性，有的医院可能仅是定性的指标，有的可能仅是定量的指标，相关指标之间也缺乏可比性。在新医院财务制度的引领下，医院应该遵循理论联系实际的方法，按照重要性、相关性、可比性等的顺序，创新医院预算考核指标，从而实现全面的预算绩效评价。医院项目预算考核指标应该以项目目标为基础，结合实践数据，建立多层次的评价指标，并由医院专业的绩效评价人员进行考核，根据考核结果对发现的问题进行及时解决，实现预算指标的精细化。
三、信息化处理下的预算控制
早在20世纪90年代，我国医院的财务管理就进入信息化建设时代。随着信息技术的不断更新换代，新医院财务制度强调，医院必须建立专门的信息管理部门，将医院的外部市场信息与内部的财务预算控制进行结合，加快预算管理的创新步伐，实现提升医院经济效益的最终目标。
（一）我国预算管理信息化的现状
我国公立医院的预算管理信息化至今已有近20年的历史，信息化水平不断提高，从一开始的手工编制预算，耗费人力物力，效率低下，发展到运用会计核算软件，查询电子信息，节约了人力成本的同时，提高了预算的准确性与执行力。然而，医院的公益性的特征决定了其预算必须更加严谨，但是，目前公立医院的预算系统与其他系统存在断节现象，并没有对信息化处理下的预算进行有效地控制。并且，医院前台的经营系统（HIS系统）与后台的预算管理系统不关联，也使得公立医院的预算管理信息系统仅能勉强满足旧制度的要求，而新医院财务制度对其提出了更高的希望。
（二）在新医院财务制度的引领下，强化信息化预算的控制
1、思想上提升到更高的层次
要想实现预算管理信息化的最佳控制，首先要在思想上提升一个高度，强化对其的重视。我国公立医院的预算管理信息化仍在不断发展过程中，其中，起决定作用的当属医院的高级管
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理人员的观念，当其意识到信息化下预算控制的重要性，从医院的全局发展角度进行预算管理变革，才能制定出符合新医院财务制度的信息化预算控制规划。另外，医院的其他工作人员对于预算管理信息化的理解也是很关键的，全院齐心协力，通过绩效考核的方式，将预算管理信息化下的控制建设贯彻实r