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cRNA的研究背景及其与疾病的关系长链非编码RNAl
cRNA是一类转录本长度超过200
t的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。l
cRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，l
cRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，l
cRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物基因组序列中49的序列产生的转录本是l
cRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1）虽然近年来关于l
cRNA的研究进展迅猛，，但是绝大部分的l
cRNA的功能仍然是不清楚的。生物学功能许多l
cRNA都具有保守的二级结构，剪切形式以及亚细胞定位，这种保守性和特异性表明它们是具有功能的。但l
cRNA的功能相对于microRNA和蛋白质的功能来说更加难以确定，因为目前并不能仅根据序列或者结构来推测它们的功能。根据它们在基因组上相对于蛋白编码基因的位置，可以将其分为1se
se2a
tise
se3bidirectio
al4i
tro
ic5i
terge
ic这5种类型。这种位置关系对于推测l
cRNA的功能有很大帮助。
图1根据l
cRNA在基因组上的位置，可将其分为5种类型：1se
se2a
tise
se3bidirectio
al4i
tro
ic5i
terge
ic。图中编码RNA和非编码RNA外显子分别用蓝色和红色表示。近年来通过对已发现的l
cRNA的研究表明，l
cRNA能够在多种层面调控基因的表达水平，其调控机制开始为人们所揭示（图2）。
f图2l
cRNA的作用机制。根据今年来所发现的l
cRNA的作用机制，l
cRNA主要可能具有以下几个方面的功能：1）通过在蛋白编码基因上游启动子区（桔）发生转录，干扰下游基因（蓝）的表达（如酵母中的SER3基因）。2）通过抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因（蓝）表达（如小鼠中的p15AS）。3）通过与蛋白编码基因的转录本形成互补双链（紫），进而干扰mRNA的剪切，从而产生不同的剪切形式。4）通过与蛋白编码基因的转录本形成互补双链（紫），进一步在Dicer酶作用下产生内源性的siRNA，调控基因的表达水平。5）通过结合到特定蛋白质上，l
cRNA转录本（绿）能够调节相应蛋白的活性。6）作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体。7）通过结合到特定蛋白上，改变该蛋白的胞质定位。8）作为小分子RNA，如miRNA，piRNA的前体分子转录（JeremyEWiluszetal2009Ge
esDev）。一般来说r