类口岸，拥有珠江口53公里可规模开发的深水岸线，海域面积79平方公里，航道水深135米；规划控制区32平方公里。现有的34个深水泊位中，已有25个深水泊位分别获得核准，总吞吐能力达7000万吨。现已有15个项目、12个深水泊位投产，包括集装箱、油气化工、散杂货、煤炭和粮食等码头项目，码头泊位齐全。位于虎门港的东莞首个享受国家级特殊政策的东莞保税物流中心顺利封关运作，虎门港还成功成为中国物流实验基地和国家港口物流业标准化试点，跻身大陆首批对台直航港口行列。
松山湖保税物流园区建设面积05平方公里，启动快件监管中心、空港物流中心和VMI配送中心三大项目，提供的平台包括物流基础设施平台、信息网络平台、管理服务平台、环境政策平台。后来东莞市保税物流中心转移到虎门港，只预留100亩地用作发展物流配套设施和项目。总体来说，由于定位不够清晰，配套仍未完善，管理措施和招商力度有待加强，三大物流基地的建设都比较缓慢。
四、建立三大物流产业带
东部铁路物流产业带主要包括常平大京九物流园、石龙红海物流园和茶山铁路物流园，重点发展集装箱的铁路运输和水铁联运、海铁联运等现代运输方式。利用铁路轨道交通资源，在大京九铁路的常平和樟木头沿线，发挥铁路客货运站场和农副产品批发市场的集群作用，通过企业的收购、兼并和联盟，做大做强铁路物流。
中部城市物流产业带以主城区为核心，涵括松山湖产业园、生态产业园及寮步、大朗、大岭山、高等周边镇。由于东莞处于珠三角腹地，毗邻香港、深圳和广州等中心城市，拥有良好的区位优势和完善的交通系统。利于建设专业物流中心、物资配送中心、快件分拨中心和城市生活物资分拨配送中心。可以有效提高城市居民生活消费品配送效率。配送技术和设施设备的改造升级，推进商品配送操作自动化、仓储立体化、配送网络化和服务标准化。
西部沿海物流产业带以虎门港为重心。涵括长安新区、沙田镇、虎门镇、麻涌镇和洪梅镇。虎门港重点有三大区块，首先，沙田港区西大坦商贸主港区：主要发展多用途泊位运输、保税物流、专业物流、港口城市综合性配套服务等。其次，沙田港区立沙岛石化基地：主要发展石化码头运输、石化仓储，以安全环保、高科技和高附加值为特色的精细化工产业，先进装备制造业以及战略性新兴产业。麻涌港区新沙南作业区：主要发展散杂货码头运输、仓储以及粮食、粮油加工业。虎门港拥有优越的自然条件和地理位置，与周边的广州南沙港、深圳港和香r