简介安装
Pymol是一个开放源码,由使用者赞助的分子三维结构显示软件,由Warre
LyfordDeLa
o编写,并且由DeLa
oScie
tificLLC负责商业发行。Pymol被用来创作高品质的分子(特别是生物大分子如蛋白质)三维结构。据软件作者宣称,在所有正式发表的科学论文中的蛋白质结构图像中,有四分之一是使用Pymol来制作的。Pymol名字的来源:“Py”表示该软件基于pytho
这个计算机语言,“Mol”则是英文分子(molucule)的缩写,表示该软件用来显示分子结构。由于实验需要,本人正在学习该软件,在这里把学习过程记录下来,希望对有需要的朋友有所帮助。今天先来说说安装吧。自2006年8月1日起,DeLa
oScie
tific对事先编译好的PyMOL执行程序(包括beta版)采取限定下载的措施。目前,只有付费用户可以取得。不过源代码目前还是可以免费下载,供使用者编译。如果你和我一样,不想为此花钱的话:
1如果你是Wi
dows用户,首先下载Pymol的源代码。然后安装CygWi
,并且确保正确安装以下模块:Cgccorgpackage
amePytho
Ope
GLPNG
然后在源代码目录里面依次运行:
2如果你是Li
ux用户,首先确保以下东东已安装:Pytho
PmwOpe
GLdriver(我用的是NVdia)libp
gSubversio
clie
t(下载源代码需要)
然后下载Pymol的源代码
mkdirpymolsrc
sv
co
httpspymolsv
sourceforge
etsv
rootpymoltru
kpymol
pymolsrc
然后进入源代码目录
cdpymolsrc
开始依次编译
fpytho
setuppyi
stallpytho
setup2pyi
stall拷贝执行脚本到某个PATH,安装就搞定了cppymolusrbi
如果运行时得到错误信息