敏度的紫外检测器或其它光电类检测器。控制好柱子和流动相的温度，在检测器之前使用热交换器图2、流动相不均匀流动相条件变化引起的基线漂移大于温度导致的漂移。使用HPLC级的溶剂，高纯度的盐和添加剂。流动相在使用前进行脱气，使用中使用氦气。3、流通池被污染或有气体用甲醇或其他强极性溶剂冲洗流通池。如有需要，可以用1M的硝酸。（不要用盐酸）4、检测器出口阻塞高压造成流通池窗口破裂，产生噪音基线取出阻塞物或更换管子。参考检测器手册更换流通池窗5、流动相配比不当或流速变化更改配比或流速定期检查流动相组成及流速6、柱平衡慢，特别是流动相发生变化时用中等强度的溶剂进行冲洗，更改流动相时，在分析前用1020倍体积的新流动相对柱子进行冲洗
f7、流动相污染、变质或由低品质溶剂配成（检查流动相的组成。使用
高品质的化学试剂及HPLC级的溶剂）
8、样品中有强保留的物质（高K’值）以馒头峰样被洗脱出，从而表现
出一个逐步升高的基线。（使用保护柱，如有必要，在进样之间或在分
析过程中，定期用强溶剂冲洗柱子）
9、使用循环溶剂，但检测器未调整（重新设定基线。当检测器动力学
范围发生变化时，使用新的流动相）
10、检测器没有设定在最大吸收波长处。（将波长调整至最大吸收波长
处
HPLC分析中，在色谱柱正常，样品灵敏度足够，分析方法合适，色谱峰在出峰时间较短的条件下（不包括梯度），峰型应对称而尖锐。但是，在对样品了解程度不够，方法不妥，样品处理方法及进样方式不合理下，会出现各种意想不到的问题，而对色谱峰难以作出合理的解释，尤其对于新手更是如此。色谱双峰指的是明明是同一种物质，但在色谱图中出现双峰，而表明含二种物质。这种情况分为四种原因。
1色谱柱如果你分析样品时发现每个色谱峰都双峰出现（出峰越快，双峰的可能性会减少），尤其采用单一纯物质时，可以肯定色谱柱出问题－保护柱污染或柱头固定相变脏或流失，或颗粒聚集在色谱柱的入口筛板上。如果进样量少，原来色谱柱正常，色谱峰的形状多为一大峰带一小峰，不一定拖尾，这一般应是柱头受堵，将色谱柱反过来接，用流动相冲洗或酸洗或其它溶剂，将堵在柱头的残留物冲掉，再反过来，一般情况下就行了。当然不反冲，正冲有时也会正常的。
如果峰拖尾，双峰强弱相差不大，柱头固定相变脏或流失可能性更大，这是可以将进样那头拧开，将微孔滤片超声，柱头刮去一部分填料，重新填上新填料拧r