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（一）政府机构按部门划分的行政管理制度难以改变
在东北区域内，各级政府机构部门由于维持计划经济时期的思想，各部门之间的协调合作显得较为困难，例如，在南方沿海省份的一项批文由于各省份的协调合作几天就可以下发，但是在东北地区，由于各部门各自为政，一项批文必须按顺序在各部门间进行，直到数月后批文才会下发，市场上的机会稍纵即逝，所以大部分的企业都会因为政策的不透明性而将不在东北区域进行投资。
（二）要素与产品市场受政府干涉较大，没有强烈的市场理念
在东北地区，由于地区政府的保护主义，其他地区的资源和产品很难自由流动进入当地市场，这样导致了竞争的缺乏，一些产能落后的企业不能淘汰，同时一些技术高端的企业由于市场份额不能扩张而难以发展。区域内经济长时间由于此而处于停歇的状态。同时由于政府对企业的干预过多，企业的决策难以自主化，对市场的把握更多的偏向政府的控制，这极大的削减了企业的积极性。
（三）区域间竞争激烈，地区间采取保护策略限制市场的有效竞争
由于缺乏核心城市的牵引，使得东北三省内各区域形成了恶性竞争，长春、哈尔滨、沈阳三省会争抢资源、人才、产品的现象时有发生。由于区域间的恶性竞争，区域间难以达成一致共识，导致各区域产业都集中在同几个优秀行业，这为产业同质埋下了伏笔，也给实现完整产业链带来了极大的阻碍。区域内的保护策略使得企业失去扩大市场的积极性，阻碍了企业的扩张发展。
三、推动东北地区区域经济一体化发展的策略
（一）转变区域经济发展模式，实现资源自由化流动
在东北区域内，由于行政区域内存在严重的区域市场划分，使得资源与产品不能有效的进行自由流动。市场一体化的形成可以使得要素和产品能在市场上自由的流动，从而有效利用东北区域拥有的优质资源，使得产品的成本的下降，还能通过市场的有效竞争。在产品市场的一体化实现同时，我们还要促进劳动力市场一体化、资本市场一体化以及科技市场一体化，进行实现区域内全面的合作交流，实现真正意义上区域内整体市场的一体化。
（二）发挥区域优势形成完整的产业链，以产业一体化为战略目标
东北区域在计划经济时期就形成了以重工业以及化学工业为主的产业结构，同时由于东北地域的地理结构，肥沃的土地和广阔的平原环境让东北区域成为我国的粮仓基地，为老百姓的日常生活提供了保障。而这些产业结构短期之内都是难以改变的，所以我们必须在原有的基础
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